故事发生在明朝末年的龙门客栈，英勇的义士们为了拯救忠良之后，与权奸曹少钦展开了一场惊心动魄的斗争。

一个架空世界，核大战中变成废土，在充斥辐射和变异生物的废土世界上，人类生存了下来，然而和身体的变异相应的，人类的心灵也在腐蚀变异，各种在战前被文明世界视为邪恶、异端的思潮和邪恶组织如辐射之地的苔藓，在肆无忌惮的扩张势力，我们要说的故事，就是……

——江湖，不止有刀。一个综合和《龙门客栈》和《武侠》特点武侠故事。

该片讲述的是龙门客栈被烧毁三年后的故事，明朝西厂督主雨化田追杀怀了龙胎的妃子和抗击朝廷的赵怀安而来到这处客栈，当年风骚的老板娘金镶玉早已神秘失踪，只剩下逃过火劫的伙计们重起炉灶，痴等老板娘回来。西厂密探、鞑靼商队等江湖各路人马，再度相逢。几……

尧舜时期，姒鯀采用“息壤封堵”治水法失败被杀，大禹接手父任，采用“开山疏流”治水法，率众开凿龙门河道，蚩蛟等人设计陷害，使大禹屡屡陷入被动和危机。在女娇和瑶姬的暗助下，几度寒暑、历经艰险，大禹战胜了蚩蛟他们，凿开了龙门，疏通了华夏治水第一条……

1938年12月下旬，日寇凭借樱子绘制的《河西军事布防图》，企图从黄河龙门西渡，进犯陕西。据守龙门的新八师，在中共特工秦枫和军统特工萧兰的情报支援下经过浴血奋战，终于粉碎了日军的西进计划。